微生物测序服务-北京中科测试
本公司提供专业的微生物测序服务，采用领先的高通量测序技术，精准解析16S/18S/ITS等基因序列，全面分析微生物群落结构、物种分类及系统进化。
提供高质量的数据报告和专业的生物信息学分析，助力科研探索与临床诊断。
微生物测序服务 — 报告示例
1、环境样品：DNA样品质检报告 >>
数据交付清单包括：
01 DNA样品质检报告
02 Agilent 5400检测常见问题解答
03 参考文献-基因组AATI检测
2、环境样品：16S扩增子QIIME2分析报告 >>
数据交付清单包括：
原始下机数据（result/01.Rawdata）
过滤后数据（result/00.cleandata）
物种注释数据（result/02.FeatureAnalysis）
物种可视化（result/03.TaxonVisual）
群落多样性（result/04.AlphaDiversity）
群落结构多样性数据（result/05.BetaDiversity）
统计检验（result/06.StatisticalTest）
关联分析（result/07.CorrelationAnalysis）
功能分析（result/08.FunctionPrediction）
环境因子（result/09.EnvironmentFactor）
结题报告（result/report-X101SC********）
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3、环境样品：ITS扩增子QIIME2分析报告 >>
数据交付清单包括：
原始下机数据（result/01.Rawdata）
过滤后数据（result/00.cleandata）
物种注释数据（result/02.FeatureAnalysis）
物种可视化（result/03.TaxonVisual）
群落多样性（result/04.AlphaDiversity）
群落结构多样性数据（result/05.BetaDiversity）
统计检验（result/06.StatisticalTest）
关联分析（result/07.CorrelationAnalysis）
功能分析（result/08.FunctionPrediction）
环境因子（result/09.EnvironmentFactor）
结题报告（result/report-X101SC********）
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4、环境样品：Metagenome 分析结题报告 >>
扩增子测序技术 - 区域推荐
1. 16S rDNA V4区的推荐
• 粪便样本（人、动物）：
选择16S V4区是行业常见做法。
原因：大量研究和商业化服务验证，V4区在肠道菌群等宿主相关样品中能：
有效覆盖细菌多样性、引物通用性好、测序效果稳定
• 其他样本类型：
推荐同样使用V4区的样本包括：
拭子（皮肤、口腔、阴道）、水体（滤膜）、土壤（V4-5）
原因：这与16S扩增子测序在环境微生物和宿主共生微生物研究中的常规应用场景相符。
2. ITS区域的推荐
• 针对真菌ITS区域：
ITS1-F：
特点：特异性高
优势：能规避植物DNA干扰，避免宿主污染
适用场景：非常适合植物内生真菌研究，是该领域的经典引物。
ITS1-5F：
特点：特异性较低
适用场景：常用于土壤样本，以兼顾更广的真菌多样性。
微生物样品采集与保存操作规程
1、普通土壤样本采集
根据研究目的确定采样范围，取样器具要事先消毒灭菌处理，开始采样，去除表面浮土，使用乙醇火烧的铲子挖取地下5~20cm的土层，去除可见杂质后，土壤过2mm筛网，每个样品从3个及以上采样点采集并混合而成，去除杂质之后的样品每管可收集分装3g~5g，保存于无菌离心管中，置于0℃以下运回实验室，用于抽提DNA，如不能马上实验，置于-80℃保存。土壤样品强烈建议使用5ml EP或15ml、50ml离心管进行装载，并用封口膜封口，使用自封袋容易撒漏导致样品交叉污染。
2、根际土壤样本采集
使用的工器具要事先消毒灭菌处理，采集20cm深的根际土壤于50mL的无菌管里，迅速放在液氮里储存，用20目的筛子过筛，去除植物根、动物残骸以及其他杂质后分装到无菌离心管里，每管3~5g，密封后立即-80℃储存备用。
3、水体样本采集
根据研究目的确定采样深度和范围，采集好的水样需要通过滤膜进行过滤，可以根据水样的浑浊程度选择相应孔径的滤膜，之后-80℃保存备用。
清洗水样：可选择小孔径的滤膜，一般选0.22μm或0.45μm的滤膜，过滤水样体积大于10L；
浑浊水样：过滤前静置分离悬浮颗粒，也可以用大孔径的滤膜预过滤一遍，再用小孔径的滤膜进行过滤。
水样过滤之后，可将微生物富集的滤膜装在 50ml 离心管中（滤膜面积不应过大，取直径 3-4cm 富含微生物的部分即可），或使用缓冲液洗脱滤膜，将洗脱后的缓冲液置于离心管中并用封口膜封口，公司不接受大体积未过滤的水样。
